МОЗГ

Междисциплинарный семинар Руководитель семинара — К.В. Анохин

Рубрики

Семинары




MAR/SAR: функции



Главная » Биология клетки » MAR/SAR: функции

Ноябрь 8, 2012

Возникает вопрос о том, каким образом соотносятся результаты между исследованиями взаимодействия ДНК с матриксом различными методами. Первые исследования говорили о различии между взаимодействиями, выявляемыми с использованием LIS-экстракции и высокосолевой экстракции ( Mirkovitch J. ea,
1984 ). Так, в активных районах генома метод высокосолевой экстракции позволяет увидеть взаимодействие транскрибируемой ДНК с нуклеоскелетом, тогда как MARs (SARs) - это специфические последовательности, и их взаимодействие с ядерным матриксом не зависит от транскрипции, и вообще, от функциональной активности генома.Однако в эритроцитах птиц в нетранскрибируемых районах активных ядер взаимодействия одних и тех же последовательностей ДНК с ядерным матриксом выявляются как методом высокосолевой экстракции и LIS экстракции, так и связыванием in
vitro (Mirkovitch J. ea, 1984, Razin S.V. ea, 1991 48).

Исходя из этих фактов, MAR-элементы, видимо, участвуют в организации сайтов перманентного связывания хроматина с матриксом. Некоторые данные говорят об их неоднородности. Так часть
MAR-элементов связывается со скелетом метафазных хромосом (MARs фланкирующего региона гена БТШ-70 дрозофилы, гена алькогольдегидрогеназы, генов Sgs-4). В то же время MAR- элементы, расположенные внутри гена дегидрофолатредуктазы (т. н. интрагенные
MARs), не связываются с хромосомным скелетом, но уже через 2 часа после митоза связывание их с матриксом можно обнаружить (Kas E. and Chasin L. A., 1987, Mirkovitch J. ea, 1988). Это может быть обусловлено как приготовлением препаратов в различных условиях, так и реальным различием в организации сайтов взаимодействия хроматина с матриксом. Таким образом, возможно, имеет смысл говорить о MAR-элементах, присутствующих как в метафазных хромосомах так и в интерфазном ядре, и внутригенных MAR- элементах, ассоциированных с ядерным матриксом только в интерфазе. Другие исследования говорят о том, что у некоторых объектов расположение MAR- элементов не соответствует позициям хромомеров в данном регионе (
Mirkovitch J. ea, 1986).

Может быть это связано с тем, что в геноме существует два класса петель: поддерживающие структурную организацию хроматина, и ответственные за какие-либо функции, например поддержание транскрипционного статуса клетки или репликацию.

Поскольку MAR-элементы были найдены во фланкирующих регионах, так же как и в кодирующих последовательностях (Phi-Van and Stratling W. H.,
1989), по-видимому их функция не зависит от относительного положения в геноме.

Биологическая роль MAR/SAR-элементов остается неясной. До последнего времени отсутствовали прямые экспериментальные данные, показывающие, что MAR/SAR-элементы могут участвовать в фиксации концов петель ДНК в живых клетках. Напротив, было показано, что, по крайней мере, некоторые MAR/SAR-элементы могут быть удалены из ядер посредством электроэлюции в растворе с физиологическими значениями ионной силы [ Eggert ea 1991, Hempel ea 1996 ]. Это позволяло утверждать, что, по крайней мере, данные MAR/SAR-элементы не прикреплены к ядерному матриксу. Дополнительная информация о возможном участии MAR/SAR-элементов в закреплении концов петель ДНК на ядерном матриксе была получена в наших опытах по картированию границ петель ДНК в протяженных областях генома с использованием метода вырезания петель ДНК топоизомеразой II ядерного матрикса.

Заметка: Межрегиональная общественная организация Содействия общественному здравоохранению — МООСОЗ – неправительственная организация, работающая для специалистов в области общественного здоровья. Подробнее на официальном сайте http://www.publichealth.ru

Смотрите также:

  • ДНК: взаимодействие с ядерным матриксом (LIS-экстракция)

  • Компетентные органы САР обнаружили приборы-шпионы